藥用植物種質資源活體保存圃(以下簡稱百草園)，位于吉林省吉林市左家鎮自然保護區，始建于1985年，2018年學校對園區進行了升級改造，全面打造具有吉林省特色的長白山道地藥材種質資源活體保存圃。園區以資源保護為基礎，科學研究為核心，中草藥文化為内涵，逐步建成了以東北道地藥用植物物種活體保存、教學教研、中藥科普、旅遊觀光為一體的綜合性科研園區。

園區占地面積6.42公頃，分為藥用喬木植物區、藥用灌木植物區、藥用藤本植物區、一年生草本藥用植物區、多年生草本藥用植物區、遮蔭藥用植物區、水生藥用植物區、濕生藥用植物區等八個大區，并擁有長200米的藥用植物長廊，現有東北道地藥用植物300餘種，種質資源達3000餘份，涵蓋了北方大部分藥用植物，是目前東北地區面積最大、種類最多、曆史最為悠久的的藥用植物種質資源活體保存圃，有“小長白山”之稱。主要的藥用植物有人參、林下參、五味子、蒼術、平貝母、關防風、闆藍根、淫羊藿、自藓、苦參、桔梗、鐵線蓮、山蘭等。

百草園承擔着普及中藥材先進種植技術和農業新成果的重任，為中藥工作者提供藥用植物多樣性保護政策制定和藥用植物資源相關産業、行業發展的技術咨詢和服務；承擔着提高公衆對藥用植物了解、提高學生實踐能力的重任。同時與吉林省人參工程技術研究中心、教育部分子遺傳學重點實驗室及中藥生産及加工企業全面合作，技術力量雄厚，科研成果顯著。

百草園也受到國内外專業人士和省内其他高校的關注和青睐，吸引了國内外專家及吉林大學、吉林農業大學、東北師範大學、長春中醫藥大學等高校的師生來種源圃參觀、學習。每年接待國内外專家50餘人次，全省中藥材種植戶500餘人次，全省高校學生及相關科研人員超過1200人次。